Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSX7Q7RTT5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSX7Q7RTT5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms