Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP50Q70EL3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP50Q70EL3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms