Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf139Q6ZV77 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms