Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TPGS1Q6ZTW0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPGS1Q6ZTW0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms