Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LIAT1Q6ZQX7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms