Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4T0

C12orf54, Uncharacterized protein C12orf54, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf54Q6X4T0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C12orf54Q6X4T0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms