Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRIG3Q6UXM1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms