Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms