Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWI4

SHISA2, Protein shisa-2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA2Q6UWI4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHISA2Q6UWI4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms