Protein–RNA interactions for Protein: Q6UDR6

SPINT4, Kunitz-type protease inhibitor 4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT4Q6UDR6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPINT4Q6UDR6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms