Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTC41PQ6P2S7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC41PQ6P2S7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms