Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGMBQ6NW40 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGMBQ6NW40 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms