Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCAPH2Q6IBW4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms