Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC102BQ68D86 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms