Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
STRIP1Q5VSL9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
STRIP1Q5VSL9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms