Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms