Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CC2D1BQ5T0F9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CC2D1BQ5T0F9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CC2D1BQ5T0F9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CC2D1BQ5T0F9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CC2D1BQ5T0F9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CC2D1BQ5T0F9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CC2D1BQ5T0F9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CC2D1BQ5T0F9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CC2D1BQ5T0F9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CC2D1BQ5T0F9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CC2D1BQ5T0F9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CC2D1BQ5T0F9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CC2D1BQ5T0F9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CC2D1BQ5T0F9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CC2D1BQ5T0F9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CC2D1BQ5T0F9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CC2D1BQ5T0F9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CC2D1BQ5T0F9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CC2D1BQ5T0F9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CC2D1BQ5T0F9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CC2D1BQ5T0F9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CC2D1BQ5T0F9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CC2D1BQ5T0F9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CC2D1BQ5T0F9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CC2D1BQ5T0F9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CC2D1BQ5T0F9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms