Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PCID2Q5JVF3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PCID2Q5JVF3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PCID2Q5JVF3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PCID2Q5JVF3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PCID2Q5JVF3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PCID2Q5JVF3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PCID2Q5JVF3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms