Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XKR3Q5GH77 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XKR3Q5GH77 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms