Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C4orf17Q53FE4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms