Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SBK1Q52WX2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SBK1Q52WX2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms