Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVEP1Q4LDE5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SVEP1Q4LDE5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms