Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KRTAP21-1Q3LI58 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms