Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTU2Q2VPK5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms