Protein–RNA interactions for Protein: Q17RQ9

NKPD1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKPD1Q17RQ9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKPD1Q17RQ9 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
NKPD1Q17RQ9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NKPD1Q17RQ9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKPD1Q17RQ9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKPD1Q17RQ9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKPD1Q17RQ9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKPD1Q17RQ9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKPD1Q17RQ9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKPD1Q17RQ9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKPD1Q17RQ9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKPD1Q17RQ9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKPD1Q17RQ9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKPD1Q17RQ9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKPD1Q17RQ9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKPD1Q17RQ9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKPD1Q17RQ9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKPD1Q17RQ9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKPD1Q17RQ9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKPD1Q17RQ9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKPD1Q17RQ9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NKPD1Q17RQ9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKPD1Q17RQ9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKPD1Q17RQ9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKPD1Q17RQ9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKPD1Q17RQ9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NKPD1Q17RQ9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKPD1Q17RQ9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKPD1Q17RQ9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms