Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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