Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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