Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM187BQ17R55 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM187BQ17R55 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms