Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FXNQ16595 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FXNQ16595 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FXNQ16595 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FXNQ16595 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FXNQ16595 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FXNQ16595 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FXNQ16595 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FXNQ16595 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FXNQ16595 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FXNQ16595 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FXNQ16595 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FXNQ16595 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FXNQ16595 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FXNQ16595 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FXNQ16595 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FXNQ16595 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FXNQ16595 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FXNQ16595 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FXNQ16595 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FXNQ16595 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FXNQ16595 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FXNQ16595 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FXNQ16595 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FXNQ16595 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FXNQ16595 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FXNQ16595 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FXNQ16595 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FXNQ16595 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FXNQ16595 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FXNQ16595 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FXNQ16595 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FXNQ16595 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FXNQ16595 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FXNQ16595 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FXNQ16595 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FXNQ16595 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FXNQ16595 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FXNQ16595 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FXNQ16595 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FXNQ16595 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FXNQ16595 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FXNQ16595 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FXNQ16595 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FXNQ16595 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
FXNQ16595 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FXNQ16595 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FXNQ16595 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FXNQ16595 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FXNQ16595 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FXNQ16595 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FXNQ16595 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FXNQ16595 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FXNQ16595 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FXNQ16595 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FXNQ16595 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FXNQ16595 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FXNQ16595 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FXNQ16595 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FXNQ16595 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FXNQ16595 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FXNQ16595 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FXNQ16595 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FXNQ16595 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FXNQ16595 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FXNQ16595 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FXNQ16595 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FXNQ16595 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FXNQ16595 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FXNQ16595 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FXNQ16595 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FXNQ16595 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FXNQ16595 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FXNQ16595 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FXNQ16595 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FXNQ16595 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FXNQ16595 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FXNQ16595 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FXNQ16595 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FXNQ16595 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FXNQ16595 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FXNQ16595 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FXNQ16595 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FXNQ16595 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FXNQ16595 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FXNQ16595 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FXNQ16595 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FXNQ16595 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FXNQ16595 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FXNQ16595 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FXNQ16595 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FXNQ16595 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FXNQ16595 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FXNQ16595 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FXNQ16595 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FXNQ16595 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FXNQ16595 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FXNQ16595 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FXNQ16595 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FXNQ16595 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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