Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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