Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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