Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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