Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
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