Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CNN3Q15417 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms