Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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BRD3Q15059 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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BRD3Q15059 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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BRD3Q15059 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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BRD3Q15059 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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BRD3Q15059 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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BRD3Q15059 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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BRD3Q15059 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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BRD3Q15059 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
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