Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NCAPHQ15003 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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