Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.78■■■□□ 2.84
GAPVD1Q14C86 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC32.78■■■□□ 2.84
GAPVD1Q14C86 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
GAPVD1Q14C86 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
GAPVD1Q14C86 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
GAPVD1Q14C86 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
GAPVD1Q14C86 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
GAPVD1Q14C86 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GAPVD1Q14C86 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GAPVD1Q14C86 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GAPVD1Q14C86 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
GAPVD1Q14C86 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GAPVD1Q14C86 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GAPVD1Q14C86 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GAPVD1Q14C86 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GAPVD1Q14C86 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
GAPVD1Q14C86 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
GAPVD1Q14C86 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GAPVD1Q14C86 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
GAPVD1Q14C86 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
GAPVD1Q14C86 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
GAPVD1Q14C86 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
GAPVD1Q14C86 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
GAPVD1Q14C86 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC32.76■■■□□ 2.84
GAPVD1Q14C86 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.84
GAPVD1Q14C86 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
GAPVD1Q14C86 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
GAPVD1Q14C86 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
GAPVD1Q14C86 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
GAPVD1Q14C86 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
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