Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FHL3Q13643 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms