Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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