Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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PEX6Q13608 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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PEX6Q13608 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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PEX6Q13608 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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PEX6Q13608 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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PEX6Q13608 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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