Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NAE1Q13564 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms