Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TOP3AQ13472 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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