Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3FQ13275 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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