Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF6Q13247 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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