Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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FOXC1Q12948 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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FOXC1Q12948 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXC1Q12948 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXC1Q12948 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
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FOXC1Q12948 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXC1Q12948 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXC1Q12948 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXC1Q12948 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXC1Q12948 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXC1Q12948 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXC1Q12948 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXC1Q12948 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXC1Q12948 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXC1Q12948 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXC1Q12948 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXC1Q12948 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXC1Q12948 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXC1Q12948 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXC1Q12948 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXC1Q12948 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXC1Q12948 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXC1Q12948 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXC1Q12948 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXC1Q12948 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXC1Q12948 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXC1Q12948 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXC1Q12948 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXC1Q12948 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXC1Q12948 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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