Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMAN2Q12907 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms