Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
STX4Q12846 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
STX4Q12846 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
STX4Q12846 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
STX4Q12846 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
STX4Q12846 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
STX4Q12846 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
STX4Q12846 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
STX4Q12846 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
STX4Q12846 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
STX4Q12846 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STX4Q12846 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
STX4Q12846 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STX4Q12846 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STX4Q12846 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STX4Q12846 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
STX4Q12846 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STX4Q12846 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STX4Q12846 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STX4Q12846 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STX4Q12846 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STX4Q12846 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STX4Q12846 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STX4Q12846 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STX4Q12846 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STX4Q12846 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STX4Q12846 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
STX4Q12846 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
STX4Q12846 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
STX4Q12846 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
STX4Q12846 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
STX4Q12846 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STX4Q12846 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STX4Q12846 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
STX4Q12846 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
STX4Q12846 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
STX4Q12846 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STX4Q12846 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
STX4Q12846 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STX4Q12846 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STX4Q12846 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
STX4Q12846 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
STX4Q12846 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STX4Q12846 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
STX4Q12846 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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STX4Q12846 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STX4Q12846 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STX4Q12846 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STX4Q12846 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STX4Q12846 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
STX4Q12846 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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STX4Q12846 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STX4Q12846 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
STX4Q12846 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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STX4Q12846 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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STX4Q12846 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
STX4Q12846 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STX4Q12846 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STX4Q12846 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STX4Q12846 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STX4Q12846 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STX4Q12846 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STX4Q12846 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STX4Q12846 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STX4Q12846 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STX4Q12846 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STX4Q12846 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STX4Q12846 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STX4Q12846 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STX4Q12846 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STX4Q12846 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STX4Q12846 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STX4Q12846 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STX4Q12846 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STX4Q12846 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STX4Q12846 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STX4Q12846 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STX4Q12846 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STX4Q12846 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STX4Q12846 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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