Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TROQ12816 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TROQ12816 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TROQ12816 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TROQ12816 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
TROQ12816 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TROQ12816 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TROQ12816 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TROQ12816 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TROQ12816 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TROQ12816 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TROQ12816 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TROQ12816 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TROQ12816 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TROQ12816 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TROQ12816 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TROQ12816 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
TROQ12816 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TROQ12816 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
TROQ12816 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TROQ12816 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TROQ12816 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
TROQ12816 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TROQ12816 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TROQ12816 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TROQ12816 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TROQ12816 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
TROQ12816 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TROQ12816 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TROQ12816 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TROQ12816 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TROQ12816 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
TROQ12816 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TROQ12816 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
TROQ12816 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TROQ12816 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TROQ12816 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TROQ12816 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TROQ12816 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TROQ12816 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TROQ12816 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TROQ12816 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
TROQ12816 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
TROQ12816 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
TROQ12816 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TROQ12816 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TROQ12816 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TROQ12816 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TROQ12816 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TROQ12816 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TROQ12816 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TROQ12816 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
TROQ12816 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TROQ12816 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TROQ12816 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TROQ12816 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TROQ12816 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TROQ12816 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TROQ12816 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
TROQ12816 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TROQ12816 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TROQ12816 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TROQ12816 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TROQ12816 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TROQ12816 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TROQ12816 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
TROQ12816 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TROQ12816 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TROQ12816 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TROQ12816 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TROQ12816 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TROQ12816 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TROQ12816 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TROQ12816 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TROQ12816 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TROQ12816 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TROQ12816 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TROQ12816 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TROQ12816 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TROQ12816 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TROQ12816 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TROQ12816 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TROQ12816 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TROQ12816 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TROQ12816 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TROQ12816 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
TROQ12816 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TROQ12816 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TROQ12816 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TROQ12816 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TROQ12816 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TROQ12816 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TROQ12816 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TROQ12816 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TROQ12816 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
TROQ12816 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TROQ12816 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TROQ12816 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TROQ12816 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TROQ12816 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
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