Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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