Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBRQ0VD83 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBRQ0VD83 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms